La reciente publicación de una encuesta genómica europea marca un hito en el control de la resistencia antimicrobiana al ofrecer el mapa más detallado hasta el momento de las Enterobacterales resistentes a carbapenémicos y colistina en el entorno hospitalario. Estos patógenos están clasificados como de prioridad crítica debido al elevado riesgo que suponen para la seguridad del paciente, dada la escasez de opciones terapéuticas y un arsenal de nuevos antibióticos todavía insuficiente.
Los resultados de esta investigación, realizada con datos de 2019, aparecieron en la revista 'Lancet Microbe' mediante artículos específicos sobre 'Klebsiella pneumoniae' y 'Escherichia coli', acompañados de un informe técnico del Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. La coordinación corrió a cargo del propio centro junto a la Agencia de Salud Pública de Suecia y la Universidad de Oxford, integrando datos de más de 300 hospitales de 36 países recolectados en 2019.
Este trabajo supuso un cambio de modelo respecto a evaluaciones previas, al pasar de un enfoque meramente epidemiológico a una vigilancia genómica integrada. La iniciativa incluyó programas de capacitación y ejercicios de garantía de calidad externa que permitieron a los laboratorios nacionales de referencia de la red EURGen-Net mejorar su capacidad de detección y respuesta ante bacterias resistentes.
Evolución de los linajes de alto riesgo
La situación epidemiológica de 'K. pneumoniae' mostró que los linajes de alto riesgo detectados hace una década continuaron circulando por los centros hospitalarios europeos. Los investigadores observaron cambios inquietantes, como el aumento de la adquisición de genes de carbapenemasa por parte de estas estirpes y la expansión de nuevos linajes con mayor capacidad de difusión. Además, se detectó un incremento de aislados que albergan genes de virulencia, lo que complica el manejo clínico de estas infecciones.
En el caso de 'E. coli', el estudio identificó señales de alarma que apuntan a un empeoramiento del escenario en Europa. Destacó la detección creciente de aislados portadores del gen de carbapenemasa NDM-5. Según los expertos, existe un riesgo elevado de que estas cepas de 'E. coli' se vuelvan endémicas en el continente si no se implementan acciones de salud pública adicionales de forma inmediata.
Hacia una vigilancia en tiempo real
Los datos obtenidos sirven como base de referencia para futuras investigaciones y subrayan el papel de la genómica en el seguimiento de la resistencia. Actualmente se encuentra en marcha la recogida de información para la tercera encuesta, denominada CRE25, que aplicará un protocolo de muestreo simplificado para agilizar la obtención de resultados.
Este nuevo proceso de vigilancia se apoyará en la mayor capacidad de secuenciación de genoma completo de los laboratorios nacionales. El objetivo final es consolidar un sistema de información rápida que permita monitorizar los patrones epidemiológicos, que actualmente varían desde casos esporádicos hasta la circulación endémica según el país, para guiar con precisión las intervenciones sanitarias necesarias.
Lilisbeth Perestelo: 
